<div dir="ltr">Dear Tex Live, <div>I had a sudden problem with knitting my Rmd document to pdf with tinytex. It's been working fine until today (last successful knit of the same Rmd was yesterday). </div><div><br></div><div>All my R packages and Rstudio are up to date. </div><div>I also updated tinytex. </div><div>Still the problem persists. </div><div><br></div><div>I have used half a day now googling this problem, but can't seem to find a solution that works. </div><div><br></div><div>latex engine is xelatex if that helps</div><div><br></div><div>Here is the error: </div><div><br></div><div><i>output file: <a href="http://paper.knit.md">paper.knit.md</a><br><br>[WARNING] Citeproc: citation SI not found<br><a href="http://tlmgr.pl">tlmgr.pl</a>: package repository <a href="https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet">https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet</a> (verified)<br>[1/1, ??:??/??:??] install: pdflscape [3k]<br>running mktexlsr ...<br>done running mktexlsr.<br><a href="http://tlmgr.pl">tlmgr.pl</a>: package log updated: C:/Users/jsv399/AppData/Roaming/TinyTeX/texmf-var/web2c/tlmgr.log<br><a href="http://tlmgr.pl">tlmgr.pl</a>: command log updated: C:/Users/jsv399/AppData/Roaming/TinyTeX/texmf-var/web2c/tlmgr-commands.log<br><br>C:\Users\jsv399\AppData\Roaming\TinyTeX\texmf-dist\scripts\texlive\<a href="http://tlmgr.pl">tlmgr.pl</a>: signature verification error of C:/Users/jsv399/AppData/Roaming/TinyTeX/tlpkg/texlive.tlpdb.main.f5c4932332eb88bb88cf51695a8348dc from <a href="https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet/tlpkg/texlive.tlpdb">https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet/tlpkg/texlive.tlpdb</a>: cryptographic signature verification of<br>  C:\Users\jsv399\AppData\Local\Temp\Q_MOA2gsXT\Cg7JvFbS_B<br>against<br>  <a href="https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet/tlpkg/texlive.tlpdb.sha512.asc">https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet/tlpkg/texlive.tlpdb.sha512.asc</a><br>failed. Output was:<br>gpg: Signature made Wed Nov 17 01:54:14 2021 RST using RSA key ID 19438C70<br>gpg: BAD signature from "TeX Live Distribution <<a href="mailto:tex-live@tug.org">tex-live@tug.org</a>>"<br><br>Please try from a different mirror and/or wait a few minutes<br>and try again; usually this is because of transient updates.<br>If problems persist, feel free to report to <a href="mailto:texlive@tug.org">texlive@tug.org</a>.<br><br>tlmgr update --self<br><br>C:\Users\jsv399\AppData\Roaming\TinyTeX\texmf-dist\scripts\texlive\<a href="http://tlmgr.pl">tlmgr.pl</a>: signature verification error of C:\Users\jsv399\AppData\Local\Temp\9tmibLcD_r\YmZZ29t0OI from <a href="https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet/tlpkg/texlive.tlpdb">https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet/tlpkg/texlive.tlpdb</a>: cryptographic signature verification of<br>  C:\Users\jsv399\AppData\Local\Temp\9tmibLcD_r\P8vGmIJLsL<br>against<br>  <a href="https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet/tlpkg/texlive.tlpdb.sha512.asc">https://www.ctan.org/tex-archive/systems/texlive/tlnet/tlpkg/texlive.tlpdb.sha512.asc</a><br>failed. Output was:<br>gpg: Signature made Wed Nov 17 01:54:14 2021 RST using RSA key ID 19438C70<br>gpg: BAD signature from "TeX Live Distribution <<a href="mailto:tex-live@tug.org">tex-live@tug.org</a>>"<br><br>Please try from a different mirror and/or wait a few minutes<br>and try again; usually this is because of transient updates.<br>If problems persist, feel free to report to <a href="mailto:texlive@tug.org">texlive@tug.org</a>.<br><br>! Argument of \__sys_tmp:w has an extra }.<br><inserted text> <br>                \par <br>l.80 ...c__kernel_sys_dvipdfmx_version_int { 0 } }<br><br>! '"C:/Users/jsv399/AppData/Roaming/TinyTeX/bin/win32/extractbb"' is not recognized as an internal or external command,<br><br>! operable program or batch file.<br><br>Fejl: LaTeX failed to compile paper.tex. See <a href="https://yihui.org/tinytex/r/#debugging">https://yihui.org/tinytex/r/#debugging</a> for debugging tips. See paper.log for more info.<br>In addition: Advarselsbesked:<br>I PCA(mesh_PCA3[-c(14, 16), c(2:9)], quanti.sup = c(1, 8), graph = FALSE) :<br>  Missing values are imputed by the mean of the variable: you should use the imputePCA function of the missMDA package<br>Kørsel stoppet</i><br></div><div><br></div><div>All the best, </div><div>Mikkel</div></div>