Hi guys, thanks for your reply. That was fast!  Last night I ended up downloading the latest Latex version.<br>If I give the command "tlmgr --version" (now), this is the result:<div><br></div><div><div>[MacBook-Pro-di-Davide:~] davide% tlmgr --version</div>

<div>tlmgr revision 23117 (2011-06-23 20:00:23 +0200)</div><div>tlmgr using installation: /usr/local/texlive/2011</div><div>TeX Live (<a href="http://tug.org/texlive">http://tug.org/texlive</a>) version 2011</div><div>texlive-20110618</div>

<div><br></div><div>I went through that because I am using </div><div>\documentclass[iop]{emulateapj}</div><div>for the first time. While compiling it was complaining about some old package related to the bibliography and it was not putting any reference into the final pdf. Instead of the reference there was (?). Even though latex does not complaint any more about that package, there is still some problem with the bibliography. I do not know if you are familiar with this documentclass. If you think you can help me (if you want to :) ) I attached a snapshot of the error message.</div>

<div><br></div><div>The bibliography that I am using is something like that:</div><div><br></div><div>\begin{thebibliography}{}</div><div>\bibitem[Abell et al.(1989)]{AbellCO89} Abell, G.~O., Corwin, H.~G., Jr., \& Olowin, R.~P.\ 1989, \apjs, 70, 1 </div>

<div>\end{thebibliography}</div><div><br></div><div>I even added the line</div><div>\bibliographystyle{plainnat}</div><div>I still get the same error message and I get references between round brackets. </div><div>Any suggestion would be greatly appreciated.</div>

<div><br></div><br><div class="gmail_quote">On Sat, Jun 2, 2012 at 1:15 PM, Adam R. Maxwell <span dir="ltr"><<a href="mailto:amaxwell@mac.com" target="_blank">amaxwell@mac.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div style="word-wrap:break-word"><div class="im"><br><div><div>On Jun 2, 2012, at 10:09 , Norbert Preining <<a href="mailto:preining@logic.at" target="_blank">preining@logic.at</a>> wrote:</div><br><blockquote type="cite">

<div bgcolor="#FFFFFF"><div>Hi Davide,</div><div><br></div><blockquote type="cite"><div>

<div><font face="monospace" size="3"><div>The release version of the installation source and the installation media</div><div>do not agree: source: 2011, media: 2009</div>

<div>Please fix your location <a href="http://mirror.math.ku.edu/tex-archive/systems/texlive/tlnet" target="_blank">http://mirror.math.ku.edu/tex-archive/systems/texlive/tlnet</a> at /usr/texbin/tlmgr line 3929.</div></font></div>

</div></blockquote><div><br></div><div>Wow, the mirror you are using is more than 2 years out of date, impressive.</div></div></blockquote><br></div></div><div>Are you sure?  It looks like it has a tlpdb from 11 May 2012.</div>

<div>Could Davide be using TL 2009, which ISTR had that confusing</div><div>terminology about source & media?</div><div><br></div><div>Davide, what does tlmgr --version tell you?</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div>

<br></div><div>-- </div><div>Adam</div><div><br></div><br></font></span></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div style="text-align:left">Davide Lena<br>RIT Graduate Student<br>Astrophysical Science and Technology<br>54 Lomb Memorial Dr, Rochester, NY 14623<a href="mailto:dxl1840@g.rit.edu" target="_blank"></a><br>

<a href="http://saturn.cis.rit.edu/%7Edxl1840/" target="_blank">http://saturn.cis.rit.edu/~dxl1840/</a><br></div><br>
</div>