<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=UTF-8" http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Your example is (unfortunately) far too complex for me to answer
    your substantive question, but the sub-question "Why does
    \hyp[h]enation {<i class="">word</i>} inline [cause] the whole <i
      class="">word</i> [to] disappear ?" is much easier to answer.   <br>
    <br>
    \hyphenation {<word>} tells TeX how to hyphenate subsequent
    occurrences of <word> in the text; it does not expand to a
    word with valid hyphenation points embedded but rather expands to
    the empty set.<br>
    <br>
    Philip Taylor
  </body>
</html>